Tiga hal utama diagnosis yang diamalkan oleh dukun ialah:
- Petungan, yaitu mencari angka yang sesuai berdasarkan tanggal lahir pasien dan tanggal hari ia jatuh sakit. Angka itulah yang dijadikan pedoman untuk menentukan bentuk pengobatan yang sesuai untuk penyakit yang diidap.
- Meditasi untuk menentukan jenis penyakit serta cara mengobatinya.
- Menganalisis tanda penyakit yang dapat dikesan.
Penyembuhan dan pemulihan dilakukan dengan menggunakan obat-obatan ramuan akar kayu dan mantra. Dapat dikatakan setiap penyakit mempunyai obat ramuan akar kayu tertentu, dan ramuan itu hendaklah dijampi terlebih dahulu supaya kemanjurannya terjamin. Ada dukun yang mengobat menggunakan jampi serapah semata-mata dan tidak memerlukan ramuan akar kayu sebagai ubat. Selain itu, kekuatan batiniah dukun dapat membantu keberhasilan kegiatan penyembuhan dan pemulihan yang dilaksanakannya.
Mereka yang berminat menjadi dukun hanya dapat menuntut atau mewarisi ilmu mengobat itu, bukan kemahiran mengobatnya. Kemahiran mengobat perlu dipelajari lagi secara otodidak. Tukang obat dalam masyarakat Melayu identik dengan ramuan tanaman obat dan mantra (doa atau pinta). Oleh sebab itu, orang Melayu zaman dahulu selalu memanfaatkan perkarangan rumah sebagai tempat menanam tanaman obat (apotek hidup).
Pengobatan dapat dilakukan dengan menggunakan ramuan saja, ramuan dan mantra, ramuan, mantra, dan ritual (perantara roh), serta ada pula yang hanya membacakan mantra dan ritual. Tingkatan cara yang dipilih dalam pengobatan bergantung dengan sakit yang telah dikenali atau dianalisis oleh dukun. Jika penyakit yang diderita pasien tidak berat, biasanya dukun memilih tata-cara meracik ramuan. Pada penyakit yang lebih kuat, dukun menggunakan racikan ramuan dengan mantra. Semakin tinggi tingkatan penyakit, biasanya cara yang digunakan juga semakin rumit. Seperti sakit yang disebabkan oleh gangguan mahluk halus (setan atau jin), dukun akan menggunakan cara mantra dan ritual. Dukun akan memasuki alam gaib dan beradu kekuatan dengan makhluk halus tersebut.
